中信万通证券有限责任公司由中信证券股份有限公司控股重组原万通证券有限责任公司后于2004年设立。
1988年，中国人民银行青岛分行独资设立“青岛证券公司”，1992年改制为有限责任公司，资本金5000万元。1997年，由青岛市财政局出资4500万元控股并更名为“青岛万通证券有限责任公司”。2000年进行增资扩股，资本金增至55198万元，更名为“万通证券有限责任公司”。2002年2月开始实施以中信证券股份有限公司出资控股为主要方式的增资重组并于2003年12月完成。2004年4月更名为“中信万通证券有限责任公司”。